Через пятнадцать лет после жуткой катастрофы человечество вновь оказалось на грани смерти. На землю слетаются некие ангелы — странные существа, которые, похоже, станут вестниками апокалипсиса... Если человечество не воспользуется современными технологиями и не остановит их. Для этого были разработаны роботы серии Евангелион, управлять которыми могут лишь единицы. Для того чтобы справиться с роботом, нужно синхронизироваться с ним и вести себя так, словно это твое собственное дело. И Синдзи на самом деле не должен был становиться пилотом, но неожиданно его отец, с которым парень практически не общался, дал о себе знать. Теперь Синдзи вынужден управлять Евой...